Muy fácil, si sólo deben pagar los de Israel, crea el IVA correspondiente a ese país y para los demás paises crea un IVA con 0% y te vas a Pago --> regla de impuestos, una vez estés ahí selecciona todos los países que no quieres IVA y le seleccionas el IVA que creastes al 0% y se lo aplicas a todos, y a Israel le aplicas el IVA que le corresponde, de esta forma sólo Israel tendra que pagar su IVA y los demás países no, un saludo.
Ahi tienes una forma que dice aplicar ningún impuesto, pero a mi en muchos proyectos me ha dado problema, por eso decidí en todos crear el de 0% y aplicárselos, de esta forma nunca más me dió problemas.