Merci kingfaya pour cette astuce, j'ai donc modifié mon product.js et remplacé la ligne :
$('#our_price_display').text(formatCurrency(priceWithDiscountsDisplay * currencyRate, currencyFormat, currencySign, currencyBlank)).trigger('change');
par
$('#our_price_display').text(number_format(formatCurrency(priceWithDiscountsDisplay * currencyRate, currencyFormat, currencySign, currencyBlank))).trigger('change');
et le problème est résolu !