Effectivement, c'est géré comme ça dans prestashop, d'ailleurs, dans l'etat instantané du stock, il y a un distingo entre la quantité réelle de la quantité physique. Ce qui n'est pas normal, c'est de ne pas avoir la possibilité de choisir d'utiliser la quantité réelle et non la quantité physique pour rensigner la quantité disponible.
Donc dans l'immédiat, il faudra modifier la valeur rensignée sur la fiche produit, cad, ne pas utiliser la quantité disponible mais la quantité physique.
Pour ce faire, je pense qu'i faut aller voir dans le fichier StockAvailable.php Ligne 244 (version 1.6 de presta) et de changer la valeur $product_quantity. je pense qu'il ne faut pas utiliser la fonction getProductRealQuantities (ligne 197) mais plutôt la fonction getProductPhysicalQuantities($id_product, $id_product_attribute, $ids_warehouse = null, $usable = false)