Muchas veces se recomienda no actualizar una plataforma entera y tan grande como lo es prestashop, precisamente por este tipo de problemas. Igualmente, no se si has intentado desinstalar los módulos y volverlos a instalar.
Por otro lado, piensa que hay muchos módulos que no son compatibles con la versión 1.6 de prestashop, como por ej. nos pasa a nosotros con el módulo "1steptcheckout" de 'esPrestashop', y que tendremos listo en 1 mes aproximadamente y compatible 100% con la nueva versión de prestashop.
Al grano ... ¿Probaste a desinstalarlos? ¿Te ocurre esto con todos los módulos?