@mblfly, mira em Parámetros Avanzados > Emails.
Ya te deberían aparecer ahi todos los emails enviados, incluso los automáticos. Si no, abajo, puedes cambiar la forma de envio para smtp.
Si no te están aparecendo los emails en prestashop, tal vez debas mirar si no es cosa de tu módulo de pagos. Puede que no esté usando las clases correctas de prestashop para enviar los emails a tus clientes.