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Buenas!

Una posible solución, sería añadir una clase a los <li> y una mediaquery para pantallas de alta resolución en el custom CSS en la que se especifique un padding-bottom más pequeño que se ajuste a tus necesidades.

Otra posible solución para sitios con muchos enlaces en el menú, es hacer un menú desplegable como en los moviles.

Espero haber sido de ayuda