También lo puedes hacer como dices, pero creo que es más laborioso .
Tendrías que editar el view.tpl del order, meterle el ínput donde quieras y posteriormente editar el adminordercontroller para que lo guarde.
Al final estás en las mismas, necesitas un mínimo de conocimientos.
Te recomiendo un módulo sin lugar a dudas. Si consigues avanzarlo un poco pon las dudas e intentamos resolverlas.
Si necesitas soporte directo, puedes mandarme un mp si lo requieres.