Hola, yo decidí implementar Amazon Pay en mi tienda y la verdad es que no esta siendo fácil.
A la pregunta que realizas respeto a las condiciones, son calcadas a las de Paypal (3,4% como tarifa de procesamiento y 0,35€ como tarifa de autorización) Aquí tienes más detalles: https://pay.amazon.com/es/help/202081670
El problema que he encontrado yo es que no se integra bien en mi tienda. Hay un servicio técnico que funciona bien una vez cumples todos los requisitos como tienda y te han aceptado pero no son capaces de ayudar cuando el theme instalado no es el default. Des de Amazon me han recomendado que hable con Prestashop.
El problema aparece cuando el usuario escoge pagar con Amazon Pay, en el caso de Paypal se abre una ventana emergente independiente, pero en el caso de Amazon pay el modulo integra dentro de la pagina de resumen del pedido los campos de Amazon Pay y ahí me desmonta la plantilla la pagina, no muestra correctamente las columnas del detalle del pedido e incluso no calcula los costes de envió correctamente. Coge los costes de envio para Europa pero no para cada país o región especifica.
De momento lo he desinstalado esperando encontrar una solución aunque no parece facil.
Supongo que por la novedad del servicio aún hay que pulir muchos aspectos incluso des de Prestashop.
Esta és mi tienda: https://www.oniricat.cat/es/