Gracias JpeFranco por recordar lo del IVA del transportista, yo me había creado mi propio método con SQL pero no había caido en eso !
Si alguien utiliza el importe del envoltorio para regalo (yo lo uso, aunque para otra cosa), hay que cambiar también el campo PS_GIFT_WRAPPING_TAX de la tabla PS_CONFIGURATION para que contenga el Id del nuevo tipo de IVA.
Saludos.