Me pasa exactamente lo mismo en todas las tiendas que tenemos montadas en la version 1.5.6.2.
De hecho voy mas alla, si directamente recibes la mercancia y le indicas pedido recibido completamente, lo da de alta correctamente en las cantidades del articulo pero no en la gestion de existencias.
Sin embargo si primero lo recibes las cantidades manualmente, el pedido te queda en recibido parcialmente y luego lo marcas como recibido copletamente, lo da de alta bien en la gestion de existencias pero en el articulo lo duplica.