Υπάρχει η δυνατότητα σύνδεσης του Prestashop με συγκεκριμένα λογισμικά εμπορικής διαχείρισης μέσω γέφυρας, αλλά το κόστος απόκτησης λογισμικού, γέφυρας και φορολογικού μηχανισμού (εάν θέλετε να "κόβετε" και λιανική) είναι αρκετά μεγάλο.
Η καλύτερη λύση (και διασύνδεση με MyData) είναι η "εκ νέου" καταχώρηση των παραγγελιών, σε άλλο λογισμικό εμπορικής διαχείρισης που όμως έχει μόνο σκοπό την τιμολόγηση των παραγγελιών (Τιμολόγιο Πώλησης - Δελτίο Αποστολής, Τιμολόγιο Πώλησης σκέτο, Τιμολόγιο Παρχοσής Υπηρεσιών, Δελτίο Αποστολής, κλπ.), με αρκετά χαμηλό κόστος και χωρίς την δυνατότητα ενημέρωσης παραγγελιών στο Prestashop.